Przed zbiorem jabłek i gruszek mogą pojawić się na owocach ciemnoszare plamy znamionujące chorobę pod nazwą brunatna plamistość występującą głównie w drzewostanie zaniedbanym.

Zapobieganiu i leczeniu tej choroby sprzyja odpowiednie cięcie przewietrzające i prześwietlające korony drzew, a także opryskiwanie wyciągami roślinnymi ze skrzypu i rumianku.

Inną z chorób drzew jest brunatna zgnilizna dająca się rozpoznać po brunatnieniu i zamieraniu kwiatów, zanikaniu krótkopędów i pojawianiu się gnilnych, brunatnych plam na owocach.

Zgnilizna powodowana przez zarazki grzybowe atakuje jabłonie, śliwy, wiśnie, brzoskwinie i morele.

Należy usuwać porażone owoce i pędy, a w koniecznych przypadkach użyć Topsinu WP.